Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ThpoP40226 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ThpoP40226 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms