Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprkP35822 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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