Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin1P35438 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin1P35438 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin1P35438 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms