Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms