Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms