Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxa10P31310 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms