Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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