Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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