Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pde6aP27664 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pde6aP27664 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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