Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms