Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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