Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms