Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaraP11416 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RaraP11416 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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