Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6P10629 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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