Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms