Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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