Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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