Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms