Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Col5a1O88207 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a1O88207 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms