Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms