Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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