Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FxnO35943 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FxnO35943 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FxnO35943 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms