Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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