Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms