Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms