Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms