Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3278L7N2D2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3278L7N2D2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3278L7N2D2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3278L7N2D2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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