Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm2056J3QQ02 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm2056J3QQ02 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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