Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21818J3KMS6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms