Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms