Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms