Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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