Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms