Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms