Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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