Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29094F6Q785 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms