Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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