Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms