Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms