Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms