Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms