Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms