Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms