Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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