Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtprsB0V2N1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtprsB0V2N1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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