Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint8A7XV07 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint8A7XV07 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms