Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms