Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trmt1lA2RSY6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trmt1lA2RSY6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms