Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms