Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms